Описание тега portable-batch-system
PBS; Семейство программного обеспечения для планирования работы, широко используемого на суперкомпьютерах и кластерах.
1
ответ
Установка Grid Engine "не удается связаться с qmaster"
Я хочу установить Grid Engine на свой ноутбук. Я использую Ubuntu 11.10 под VirtualBox 4.1.6. (Цель установки Grid Engine - не вычислять что-либо, я просто хочу, чтобы рабочая среда Grid Engine могла опробовать сценарии bash для заданий массива и т.…
24 мар '12 в 15:27
1
ответ
PBS/Torque: очень простой скрипт pbsdsh с PBS_VNODENUM
Я пытаюсь отправить следующий очень простой скрипт в мой кластер: #!/bin/sh #PBS -l nodes=3:ppn=8,walltime=00:01:00 #PBS -M eamorr@mydomain.com #PBS -j oe #PBS -m bae #PBS -N geophysics pbsdsh date pbsdsh echo $PBS_VNODENUM И вот вывод: Wed Oct 24 1…
24 окт '12 в 11:58
1
ответ
Пакетные задания PBS - команда qalter
У меня гигантские вычисления на кластере Scientific Linux. В настоящее время у меня более 600 заданий, припаркованных в очереди, ожидающих процессорного времени, в то время как некоторые из них выполняются. Я пытаюсь использовать команду qalter на н…
05 окт '12 в 01:52
1
ответ
Как узнать время отправки пакетного задания PBS внутри исполняемого скрипта?
Я использую PBS qsub для запуска сценария в кластере, который должен вывести файл отчета с именем времени отправки пакетного задания. Время отправки пакетного задания - это время, когда оно присоединяется к очереди пакетного задания PBS. Я проверил …
21 июн '13 в 01:43
1
ответ
Создайте стандартный вывод задания SGE на терминал источника
Я хочу отправить отдельные задания в Sun Grid Engine и сделать так, чтобы они выполнялись локально. Вместо создания файлов stdout и stderr для их вывода на вызывающие терминалы stdout и stderr. По этой странице -k oe сохранит стандартный вывод или с…
19 мар '14 в 09:05
3
ответа
Есть ли способ проверить, сколько рабочих мест у пользователя в очереди?
Я знаю такие команды, как qsub, qstat -a, qstat -an и т. Д. Но как я могу узнать, сколько заданий в очереди у одного пользователя (не обязательно обязательно выполняется) в любой момент времени?
06 май '15 в 17:36
1
ответ
Как сохранить информацию о задании (qstat) в SGE при отправке в qsub?
При подаче работы я могу предоставить qsub с путем для стандартного вывода и стандартной ошибки. С другой стороны, пока моя работа 12345 выполняется, я могу получить доступ к дополнительной информации, связанной с ней, используя qstat -j 12345, У ме…
03 янв '14 в 17:19
0
ответов
Сколько памяти используется для определенного процесса
Я использую qsub для отправки работ в кластере (SGE). Я хочу знать, когда я отправляю задание qsub и после его завершения я хочу выяснить, сколько памяти он фактически использует, поэтому в следующий раз я предоставлю ему необходимую память на всяки…
08 мар '14 в 17:29
2
ответа
qsub -hold_jid -afterok цикл не запускается
Я пытаюсь выполнить серию заданий, переданных в кластер, одно за другим, используя следующий сценарий.sh: Annotation_Loop.sh: #!/bin/bash job=`qsub run_IntersectBed_1.sh 0` for i in {1..3} do job_next=`qsub -hold_jid $job run_IntersectBed_1.sh $i` j…
30 апр '13 в 18:37
2
ответа
Как я могу заставить режим shell-script в Emacs интерпретировать #PBS -S /bin/bash как код оболочки bash?
Я использую Emacs в системе LINUX, которая использует Portable Batch System (PBS) для управления использованием ресурсов. Сценарии PBS требуют "#PBS -S /bin/..." в качестве первой строки в сценарии, чтобы объявить оболочку сценария для PBS. Когда я …
27 авг '13 в 19:18
1
ответ
Настройка кластера
Наш кластер представляет собой кластер Linux с Torque и Maui. Я читаю учебники в Интернете и нахожу, что компиляция происходит только на головном узле, и после отправки задания qsub другие узлы запускают исполняемый файл, скомпилированный на головно…
31 янв '10 в 16:08
0
ответов
libXtst.so.6: невозможно открыть общий объектный файл: нет такого файла или каталога
ОБНОВЛЕНИЕ: после qsub я много раз замечал, что когда имя хоста - opt###, оно работает, но для других узлов, в которых имя хоста имеет другую топологию int###, - нет. Я обсуждал это с менеджером кластера, и вот что он сказал: "Каким-то образом эта б…
04 окт '11 в 05:01
0
ответов
QSUB зависает на одном пользователе в опции X
Я использую PBS для распределения рабочих мест в кластере. Обычно я могу запустить интерактивный режим X11 в узле с помощью: qsub -I -X -l select=1:vnode=gpunode1 но это не работает для нового пользователя. Это просто висит там. Я старался qstat и у…
08 июл '18 в 16:12
1
ответ
Как я могу следовать стандартной ошибке qsub?
Я работаю, используя крутящий момент (qsub). Я хотел бы следовать стандартной ошибке задания, поскольку оно выводится. Нормальные выходные файлы (для stdout а также stderr) пишутся только после окончания работы. Есть ли способ сделать что-то вроде t…
28 сен '12 в 05:44
2
ответа
Крутящий момент в кластере
Я учусь и у меня есть несколько вопросов об использовании PBS для отправки работ в кластере. (1) Если задание распараллеливается MPI и запускается mpirun без использования qsub, оно может выполняться на разных узлах. Так какой смысл использовать qsu…
31 янв '10 в 01:00
0
ответов
Работа не работает под Torque, установка Мауи не помогла
Поэтому я только что установил Torque на небольшой кластер, который мы настраиваем, и все, казалось, прошло довольно гладко. я имею pbs_mon работает на вычислительных узлах и pbs_server работает на головном узле, и pbsnodes -a Из головного узла отоб…
26 сен '11 в 16:16
1
ответ
Как я могу автоматически установить графический драйвер Intel (DCH)?
Я пытаюсь установить последнюю версию пакета графических дисков (DCH) в автоматическом режиме. Предложенные переключатели из файла readme, похоже, ничего не дают. Бегinstaller.exe -sпросто создает окна установки (свернутые), которые недоступны. Един…
05 мар '23 в 07:18
0
ответов
Почему программное обеспечение, установленное без полномочий root, может работать во всем кластере?
Недавно я установил новый пакет python3 и еще один пакет Python локально в папке своей учетной записи в кластере с дюжиной узлов (каждый узел имеет несколько ядер). Первоначально я думал, что могу Python3 запускать свои программы только на том узле,…
30 июн '22 в 04:32