Как передать изменения в XML-файл в систему контроля версий, если они были изменены пользователями веб-приложения?

Используемое нами веб-приложение администратора (с закрытым исходным кодом, стороннего производителя) генерирует XML-файлы на сервере Linux, на котором оно работает. Эти XML-файлы содержат настройки приложения для производственного приложения. Только пользователи с правами администратора могут войти в приложение, чтобы изменить эти настройки.

Как можно защитить эти файлы в системе контроля версий? Недавно мы потеряли эти XML-файлы, когда система Linux стала поврежденной.

Будет ли это включать настройку задания cron для проверки каталога на наличие изменений в этих файлах XML - и, если они будут изменены, зафиксировать изменения, используя тот же сценарий (в данном случае SVN)?

Есть лучший способ сделать это?